南京大學擁有一支高素質的師資隊伍，其中包括中國科學院院士30人，中國工程院院士4人，國家級領軍人才327人次，國家級青年人才347人次，國家科技重大專項、"973計劃"、"863計劃"、國家重點研發計劃等重大項目首席科學家103人次，國務院學位委員會學科評議組成員22人，國家級教學名師11人，"百千萬人才工程"國家級人選38人。
| 編號 | 實驗室名稱 |
| 1 | 海岸與海島開發教育部重點實驗室 |
| 2 | 中尺度災害性天氣教育部重點實驗室教育部重點實驗室 |
| 3 | 介觀化學教育部重點實驗室 |
| 4 | 現代天文與天體物理教育部重點實驗室 |
| 5 | 模式動物與疾病研究教育部重點實驗室 |
| 6 | 表生地球化學教育部重點實驗室 |
