| 序號 | 一級學科名稱 | 評估結果 |
| 1 | 農業資源與環境 | A+ |
| 2 | 植物保護 | A+ |
| 3 | 農林經濟管理 | A+ |
| 4 | 作物學 | A+ |
| 5 | 公共管理 | A |
| 6 | 園藝學 | A- |
| 7 | 食品科學與工程 | A- |
重點關注： 南京農業大學A+學科有4個，是：農業資源與環境、植物保護、農林經濟管理、作物學。這些評級為A+的學科所對應的本科專業，屬于南京農業大學排名全國第一的專業，也是南京農業大學最有名的專業。
| 序號 | 一級學科名稱 | 評估結果 |
| 1 | 畜牧學 | B+ |
| 2 | 獸醫學 | B+ |
| 3 | 農業工程 | B |
| 4 | 水產 | B- |
| 5 | 圖書情報與檔案管理 | B- |
| 序號 | 一級學科名稱 | 評估結果 |
| 1 | 風景園林學 | C+ |
| 2 | 環境科學與工程 | C+ |
| 3 | 草學 | C+ |
| 4 | 工商管理 | C |
| 評級 | 全國排名 |
| A+ | 前2%（或前2名） |
| A | 2%～5%（不含2%，下同） |
| A- | 5%～10% |
| B+ | 10%～20% |
| B | 20%～30% |
| B- | 30%～40% |
| C+ | 40%～50% |
| C | 50%～60% |
| C- | 60%～70% |
學科評估是教育部學位與研究生教育發展中心按照國務院學位委員會和教育部頒布的《學位授予與人才培養學科目錄》對全國具有博士或碩士學位授予權的一級學科開展整體水平評估
